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Polo Lacoste Italian Fit Noi descriviamo una versione rivista e

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Noi descriviamo una versione rivista e aggiornata del pacchetto di programmi SMMP (meccanica molecolare semplici per le proteine) [F. Eisenmenger, U.H.E. Hansmann, Sh. Hayryan, C.-K. Hu, Comput. Phys. Comm. 138 (2001) 192-212]. SMMP è un pacchetto FORTRAN open-source per la simulazione molecolare delle proteine ​​all'interno della geometria del modello standard. È stato progettato come uno strumento semplice e poco costoso per i ricercatori e gli studenti di familiarizzare con tecniche di simulazione della proteina. Questo annuncio descrive la prima grande revisione di questo pacchetto software e la sua appena aggiunto features.Program summaryTitle del programma: identificatore SMMPCatalogue: ADOJ-v2-0Program sintesi URL: http: //cpc.cs.qub.ac.uk/summaries/ADOJ_v2_0Program fornite da: CPC Program Library, Queen University di Belfast, N. IrelandOperating sistema in base al quale il programma è stato testato: LINUX systemProgramming lingua utilizzata: FORTRANComputer: PC PentiumNumber di linee di programma distribuito, compresi i dati dei test, ecc: 18 492Number di byte in programma distribuito, compresi i dati dei test, ecc: 278 995Distribution Formato: ASCIICard codice punzonatura: ASCIICatalogue identificatore di versione precedente: Riferimento ADOJJournal della versione precedente: F. Eisenmenger, U.H.E. Hansmann, Sh. Hayryan, C.-K. Hu, Comput. Phys. Comm. 138 (2001) 192-212Does la nuova versione sostituisce la versione precedente: YesNature di problema fisico: meccanica molecolare calcoli e simulazione Monte Carlo del proteinsReasons per la nuova versione: Aumento functionalitySummary delle revisioni: Cambiamenti nella funzione di energia e di rappresentanza delle proteine; differenze di struttura e organizzazione del programma; nuove funzionalità aggiunte; cambiamenti vari e additionsMethod Polo Lacoste Costo di soluzione: Utilizza ECEPP2 / 3 e Flex potenzialità. Include Monte Carlo algoritmi di simulazione per canonica, nonché per ensemblesRestrictions generalizzate sulla complessità del problema: Le consumati CPU tempo aumenta con Polo Lacoste Italian Fit la dimensione di proteine ​​moleculeTypical durata: dipende dalle dimensioni della molecola in simulationUnusual caratteristiche del programma: No
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